Bom dia,
Qual versão da Skill que você tinha antes? e agora? Qual versão do seu SAP?
O meu era SKILL 1.21.13.20 PL28 fui para o PL37 conforme orientação deles (rodando no SAP 9.0 PL15), não deu erro (pra falar a verdade, sempre da um aviso de tamanho de campos).
Se você tiver uma versão diferente, não pode usar o PL atual, por exemplo, você roda a versão 1.21.13.19,, primeiro tem que ir pra 1.21.13.20 PL0 (instalar ela completa) e só depois usar os PL nova.
Sobre o erro, já aconteceu comigo há muito tempo, em umas das atualizações da Skill, a recomendação deles pra mim foi "execute novamente o server, até que os erros desapareçam e você consiga finalizar a atualização", mas aconteceu umas três vezes nesses 4 anos que usamos skill.
Att
Fabio
SAP 9.0 PL15 / SAP 9.1 PL8 (Test)
SKILL 1.21.13.20 PL37