Olá Fábio.
Apesar de parecer o caminho mais longo, acredito que o ideal seria criar novos códigos de imposto e fazer as novas determinações de código de imposto. Pois muitas vezes ao alterar um código de imposto acabamos deixando passar um detalhe ou não percebemos uma situação em que aquele código de imposto era usado (inclusive manualmente pelos usuários).
Relembro que recentemente escrevi um artigo sobre determinação de código de imposto baseado em campo de usuário:
Não me recordo se é possível pegar campos do cadastro da empresa por exemplo, onde seria possível colocar um campo para definir o enquadramento. O artigo acima apresenta um cenário onde era possível mudar o código de imposto das compras de determinadas empresas, bastando mudar apenas um campo no cadastro do PN em questão, não é o seu cenário.
No passado encontrei bases do SBO com modificações em fórmulas de imposto, inclusive com regras fixas, não acredito que mexer aqui seja um caminho válido.
Enfim, ficam ai algumas observações para você ter no que pensar até o dia 01.
Abraços e um bom 2016 para todos.
Rodrigo da Costa Feula